根據聯合國難民署（UNHCR），截至2019年12月底，超過25萬名難民和尋求庇護者在埃及正式登記。一半以上來自敘利亞，其餘來自埃塞俄比亞、自厄立特里亞（Eritrea）、南蘇丹、蘇丹和葉門等國家。
在埃及，無國界醫生為居住在開羅和亞歷山大（Alexandria）的移民、難民和尋求庇護者提供以人為本的服務。
我們在開羅的項目於 2012 年展開，採用誇學科方案，適應移民和難民的特有需求，提供醫療和心理護理、性和生殖健康服務、物理治療和社會援助。 2019年，我們總共提供了16,300 次門診諮詢，當中包括8,250 次個人心理健康諮詢，2,260次物理治療。我們也提供了近 2,050 場社會援助諮詢。
2019 年，團隊治療了 737 名新的虐待或暴力倖存者。我們加強了針對心理健康的小組治療方案，為 1,140 名參加者舉辦了 110 多次節支援小組 。我們為 1,330 名性暴力受害者提供了全面護理，其中 740 人在事件發生後 72 小時內得到了治療。我們就針對女性的暴力問題加強了與民間社會、政府、主要醫療機構和學術機構的聯繫，並在年底組織了一次會議討論關於性暴力的醫療和心理傷害，基於性別的問題以及改善受害者獲得照護機會的方法。
無國界醫生開設了醫療和心理支援部門（MPSU），支援合作組織經營的診所為性暴力受害者提供全面的服務。該部門將幫助這些組織自行整合、管理和繼續這些服務。部門目前與亞歷山大和大開羅三個組織的七間診所合作。
