在無國界醫生團隊與醫院員工及義工並肩工作的20個月裏，巴沙爾醫院已多次遭遇武裝人員攜帶武器進入醫院並威脅醫護人員的事件，他們經常要求治療戰士先於其他病人。2024年11月11日，一名病人在醫院內被射殺。同年12月18日，襲擊者在急症室內開槍，直接威脅醫護人員。更早前亦發生另一宗事件，醫院內有人持槍開火，子彈直穿醫院大樓，造成一人受傷。
無國界醫生的緊急項目統籌菲力普(Claire San Filippo)表示：「我們在喀土穆目睹巨大的苦難，每天都發生激烈且極端暴力的事件。食物、物資和人道援助的短缺和封鎖令當地人須掙扎求存。當地醫療需求龐大，不少傷勢嚴重得令人震驚，處理大規模傷亡事件幾乎已成為日常。我們團隊、醫院員工和義工都在非常困難的環境下，日以繼夜工作以提供醫療護理。然而，當我們的員工和病人生命飽受威脅而沒有安全保障時，將無法繼續醫療工作。」
巴沙爾教學醫院是喀土穆南部最後幾間仍能運作，且提供免費醫療護理的醫院之一。自去年9 月底以來，隨著戰鬥升級，醫院接收的暴力創傷者人數激增。有時在住宅區和市場遭受炮擊或空襲後，同時有數十人同時送院求醫。2025年1月5日（日），距離醫院一公里外的地方發生空襲，50人被送往急症室，其中12人送院時已身亡。
與此同時，由於其他醫療設施已關閉或減少服務，我們團隊接收的兒科和婦產科病人有所增加。我們也在應對霍亂、瘧疾和登革熱爆發，並目睹令人憂慮的營養不良問題。
此前，該醫院已經面對嚴峻情況。2023 年 10 月，由於蘇丹武裝部隊封鎖了外科物資的運送，醫院只能暫時中止所有手術。蘇丹港的醫療物資運輸和員工行動現已被封鎖長達超過一年。由於面對針對員工的威脅和暴力行為，無國界醫生去年 7 月已被迫暫停鄰近土耳其醫院（Turkish Hospital） 的醫療工作。
「我們被迫停止在這間醫院支援救命的醫療護理，尤其是在醫療需求如此龐大且不斷增長的情況下，這將造成破壞性後果。每當有組織被迫暫停工作，病人就會越少機會獲得其急需的醫療護理。醫院必須是人們可放心求醫且不必冒生命危險的地方，也應是醫護人員可安全提供護理的地方。」
── 緊急項目統籌菲力普
2023 年 5 月（即戰爭爆發後不久），無國界醫生一支團隊率加入，參與重開醫院的義工和醫護人員的工作。2023 年 5 月至 2024 年 12 月期間，醫院的急症室共接收 25,585 名病人，其中 9,000 多人因爆炸傷和槍傷等暴力行為而住院。同一時期，團隊施行 3,700 宗外科手術，當中絕大部針與暴力創傷相關；協助近 3,800 次分娩，其中包括 850 次剖腹產。無國界醫生繼續在蘇丹的 11 個州開展工作，包括喀土穆州的恩圖曼（Omdurman）市。我們希望未來情況將允許組織重返巴沙爾醫院，並重啟醫療工作。
